《秘密列车》是一部由刘进导演，周杰、刘芸、王雅捷、于洋、张嘉益、马少骅和郑罗茜主演的国产剧。故事背景设定在上世纪50年代，当时中国的核工业计划正在紧锣密鼓地进行中。在这个背景下，一辆神秘的火车负责运送核专家往返于北京首都和西北核基地之间，并承担着一系列机密任务。
龙飞是北京市公安特勤所所长，他成为护送核专家行动组的负责人，并参与了第一次运送任务。他遇到了美丽的女乘务员辛红羽，并对她产生了好感。然而，在火车上有四位关键的核专家，他们对国家核武器研发计划至关重要，因此龙飞肩负着巨大责任不能有任何懈怠。
在火车上，龙飞发现并逮捕了破坏运送任务的犯罪嫌疑人。就在突审期间，火车突然遭遇到前方铁轨上放置的包裹。龙飞带领队伍赶去处理，然而火车却突然爆炸，导致四位核专家当场丧生。在调查案件的过程中，龙飞遇到了核科学家杨佑亭的女助手谢宝音。
另一方面，杜明明本来是别人介绍给龙飞的女朋友，在他出差期间却与同事肖克发展出了恋爱关系。被发现在铁轨上的包裹证实是被肢解的人体躯干，一连串碎尸案件频繁发生，使得火车爆炸案变得扑朔迷离。
最终揭开碎尸案真凶身份后，凶手尹大龙表现异常残忍和狡猾。经过精心策划后，他劫持了秘密运送的核专家杨佑亭。通过侦查工作，龙飞、肖克等人发现背后操纵者是梅花组织上级特务周明天。为了打入梅花组织内部并获取情报信息, 龙飞决定伪装成特务，并成功渗透进去。
然而令人意外的是, 杜明明也偷偷地混入周明天身边，并陷入了与周明天和肖克之间的三角恋爱中。在剧情发展过程中，辛红羽被杜明明掐死在体育馆里。被劫持的核专家杨佑亭也被发现是冒名顶替者，有人伪装成他试图进入核基地。
最终证实周明天并非爆炸案的幕后策划者，背后还有其他人。周明天被打下山崖，梅花组织的一些成员也被逮捕归案。然而平静生活下隐藏着更大罪恶和真相。谢宝音企图毒害龙飞，并杀死了辛红羽，甚至想要杀死杨教授，并最终自杀身亡。
通过一系列事件, 龙飞察觉到敌人的踪迹, 原来真正的敌人——梅花组织内部头目长期隐藏在公安组织中...
《秘密列车》延续了张宝瑞小说系列一贯惊险玄疑风格，在紧凑连贯的剧情中展现出错综复杂、正邪难辨、黑白交错的斗争。人物关系也错综复杂：情人？敌人？知己？对手？正是在他们针锋相对的斗争中，故事逐步推向高潮。
王雅捷在剧中扮演的角色成为了一大亮点，她身份的揭示带来了更加惊人的秘密，为剧情发展起到了推波助澜的作用。
目前该剧已经完成山西榆次地区拍摄，并计划在敦煌、嘉峪关等地取景拍摄。