《时间囚徒之危机》是一部由刘宇导演，囧森瑟夫、杏林儿、韩雨泽、一舟、香凝、墨兮、胀胀、雨辰、南屿和零柒等众多明星主演的国产动画电影。故事发生在2060年，为了应对各种超自然危机，世界组织成立了危情局，并从全球范围内选拔精英特工加入。其中最顶尖的特工组成了一个王牌小队——魅影。
三年前，在一次接收宝物的任务中，魅影小队遭到戴瑞克小队偷袭，并几乎全员阵亡。昊远作为队长轻信他人导致这场悲剧发生，并被戴瑞克陷害并推下悬崖。然而，在这个过程中目标宝物——永生石意外进入昊远体内，使他死而复生，并获得了操控时间的异能，拥有时间静止和倒流等超能力。从此以后，我们的主人公开始过上逃亡者的生活。
昊远选择隐姓埋名过着平凡的生活，但他不愿面对过去的伤痛和责任感，全心全意保护战友的妹妹顾小溪。然而，命运却开了一个玩笑，Y城出现了一种蓝色病毒，感染者皮肤上出现蓝色纹理，并逐渐遍布全身最终导致死亡。顾小溪也不幸被感染。为了揭开蓝色病毒事件真相并拯救顾小溪，昊远决定重返危情局。
他与性感干练的特工御姐夏柔、古灵精怪的天才萝莉童晓晓以及混迹江湖的中二大佬展鹏等奇特人物临时组成了另类魅影小队。从此开始，我们将见证这个传奇故事的发展……