《大明帝国之夜来风雨》是一部扣人心弦的国产古装剧，由郭少雄和李文龙联合执导，张晨光、任东霖、秦堰、郝蕾和张子琪领衔主演。故事背景设定在明孝宗弘治末年，当时孝宗病危，急需传位给太子。然而，太子朱厚照却不知所踪。与此同时，太子的皇叔宁王朱宸濠趁机闯入寝宫图谋不轨。年轻的皇后和大臣李东阳等人各自谋划，在寝宫中发生了一系列纷争。所有这些纷争似乎都源于太子失踪的事件。
实际上，太子只是与一群市井无赖在偏僻小客栈里玩耍胡闹而已。在醉酒之际，他意外遇到了隐居名镇当世的王阳明和他的师妹娄遗贤。两方冲突打乱了原本有利可图的局势，并且王阳明甚至动手击伤了太子。面对这种情况，太子会善罢甘休吗？他们之间又会发展出怎样的缘分呢？
整个故事中，一个默不作声的老太监刘瑾似乎身份低微，但他与大明的国运却有着千丝万缕的联系。宫中争斗在孝宗奇迹般地从垂死中苏醒后暂告一段落。然而，孝宗却更加猜忌起来，在盛怒之下竟然挥剑要杀自己的亲生儿子。太子昂然待死，眼中满是轻蔑和冷笑。父子之间究竟存在着何种难以解开的恩怨呢？
孝宗决意为国灭亲，滴血长剑步步逼近太子。张皇后和其他大臣拼死相救，并引起了孝宗更加暴怒，并命令神机营士兵阻截。众人眼看无力回天时，突然有人高喊：“太子无辜！”这让孝宗既惊又喜且愤怒不已。
到底是谁胆敢触犯天威、挽救了皇上并改变了局势呢？原来是东宫中无职无权的刘瑾。尽管刘瑾口才了得，但他又怎能蒙混过明察秋毫的孝宗皇帝呢？危急之际，正是刘瑾口中冒出的三个字改变了所有人的命运——那就是王阳明。
在圣人峰上，王阳明和他的小师妹娄遗贤等人读书、作画、耕作，一派田园景象。然而，刘瑾前来并携带着一块东广木牌。原来他是前来请王阳明先生下山的。因为除了阳明先生之外再没有其他人能够担任太子的老师。如果太子没有一个合适教导他的老师，那么他就不配做太子更不配做皇帝。请阳明先生下山也成为孝宗皇帝最后一丝指望。
虽然阳明若不下山，则太子被废除将面临必死无疑之境地。尽管刘瑾只是一个低三下四的奴才，但竟然成功地请动了阳明先生，并与小师妹成为了师徒。毕竟阳明身负绝学，内心深处还有许多尘缘未了。
阳明下山后遭遇强盗袭击，刘瑾也被扣押，并与宁王相遇。没错，就是孝宗垂死时闯入宫殿的那位王爷。阳明、小师妹和宁王展开一番较量。令人惊奇的是，他们发现彼此既是平生劲敌又是知己。两人之间的死斗由此拉开序幕。
除此之外，以李东阳为首的士大夫集团也极度反对阳明进入朝廷。在这个过程中，阳明处处都面临着敌人的围攻，并且不卑不亢地应对了孝宗下马威。然而太子叛逆的性格如何能改变呢？他深知形势严峻，并只能顺势而为。
太子朱厚照并非等闲之辈，在连连闯祸之际，阳明智计百出解决了无数难题。眼看着太子与阳明关系日益亲近，谁知后院起火时原本与阳明青梅竹马相依为命的小师妹却对宁王神魂颠倒。阳明无法挽回这一切，只能心痛地撤退。
与此同时，精通医道的宁王也给孝宗和太子下了慢性毒药。孝宗预感自己时日无多，在深夜与阳明长谈托孤。阳明慷慨答应，并伴随着孝宗突然暴毙，他与宁王之间的关系由此变成了公开争斗。
在新婚当晚，小师妹得知了一切。原来她朝思暮想的宁王竟然如此邪恶。在伤痛之余，她苦心劝说并成功将其劝走，并且带着他回到江西封地。于是，阳明和小师妹就此分别。
经历了种种艰辛后，阳明终于辅佐太子登基，并定年号为正德——即将来世称为武皇帝的年号。而曾经成为他半个朋友的刘瑾也如愿以偿，并等待着与阳明共享荣华富贵。然而事情并未就此结束，因为正是此时，拥有战功的安化王陈兵京师，一方面向朝廷示威，另一方面寻找机会推翻年轻的武宗。
大敌当前，刘瑾暂时忍耐住了对阳明的仇恨。因为只有阳明的才智和无私才