《敌后武工队》是一部由陈剑飞导演，何冰、于和伟、林永健等主演的国产剧。故事发生在1942年，日寇在我冀中平原地区实施了大规模扫荡政策，给当地抗日力量造成了严重破坏。面对更加狡猾和凶残的敌人，武工队应上级指示组建起来，并由太行山游击队骨干魏强担任领导。
冀中平原成为愤懑和饮泣之地，如何识别敌我并整合力量成为武工队面临的首要问题。他们最主要的对手是伪军头目刘魁胜。刘魁胜通过推断县大队曾经在一家堡垒户留下尿迹而发迹，并因此惨遭灭门。
武工队员们面临着各种任务：带枪通过封锁线、营救被捕区委委员汪霞、搞药品和医用器械以及运送伤员等。活地图赵庆田、独行侠刘太生、多面手贾正、走江湖的李东山等成员陆续加入武工队，并出色地完成每一个任务，引起了老鬼子松田的警惕。
汉奸丑类哈巴狗、侯扒皮和刘魁胜开始与武工队尔虞我诈，以自己的套路对抗。武工队争取了中间势力蔡村长，斗垮了劣绅周大拿，但也埋下了定时炸弹——区委委员马鸣叛变投敌。
然而，在营救行动中马鸣没有暴露反而被成功营救出来，成为隐患。在反砍树和反交粮斗争中，魏强领导的武工队取得主动权，并在群众工作方面也做得游刃有余。
刘魁胜看准时机向松田提议组建夜袭队，以机动对机动、以游击反游击。他秘密召集远乡僻壤的地痞和自己的亲信，在一个隐蔽小村庄进行各种化装、偷袭和狙击训练，使他们成为有着当地农民伪装、心毒手辣的杀手。夜袭队用各种诡计和苦肉计骗取老百姓的信任，给武工队带来了很大损失。
面对挫折，魏强依靠群众并利用情报让敌人内斗，最终借助坂本少佐之手端掉了刘魁胜的夜袭队。然而，刘魁胜再次组建夜袭队，并与马鸣和李东山勾结。在敌我交织、斗争更加复杂残酷的环境中，武工队成功策反伪军灵魂人物梁邦，并袭击破坏了日军机场。
马鸣的出卖导致武工队员刘太生牺牲，在除奸行动中武工队先是偷袭沧州城，后又潜入天津枪决叛徒马鸣，并险些刺杀日本高官冈村宁次。这次锄奸使得整个华北战局发生巨变。
随着抗战形势好转，上级要求武工队争取大面积反正伪军。他们通过政策和人心来夺取炮楼，然后利用反间计让夜袭队将不肯改邪归正的伪军当作已经投降，一一消灭。
刘魁胜抓到了意外线索并搜捕到政委杨子曾。在敌人的圈套面前，武工队没有能营救自己敬爱的领导。日本侵略军成为困兽，而那些无法面对列祖列宗的汉奸伪军却要铤而走险。
刘魁胜拉拢李东山，并利用手头掌握的日军秘密军火库企图东山再起。然而，在武工队员们围困夜袭队于坟地之时，汪霞击毙了刘魁胜。
抗日战争接近尾声，敌人更加凶狂。为了摧毁华北最后一个敌方军火库，武工队员们带着必死之心进入其中，并计划由魏强引爆最后一个火力点。
然而，在关键时刻梁邦开着装满炸药的卡车闯入山洞中，他眼前闪过他家人被日本鬼子和汉奸杀害的场景。梁邦拉响了导火索，敌人的生命在地动山摇中终结。
魏强领导的武工队完成了历史使命，并将核心成员派往新战场。这片美丽的平原重新成为中国民众新生活动的家园……